近期，市场监管总局组织食品安全监督抽检，发现的主要问题是，微生物污染、农兽药残留超标、重金属污染、质量指标不达标等。
本次抽查市场监管总局抽取了粮食加工品、食用农产品、食盐、食糖、茶叶及相关制品、乳制品、饮料、酒类、糕点、炒货食品及坚果制品、饼干、方便食品、薯类和膨化食品、蜂产品、蔬菜制品、水果制品、肉制品、水产制品、调味品、冷冻饮品、糖果制品、特殊膳食食品和食用油、油脂及其制品等23大类食品512批次样品，检出其中食用农产品、茶叶及相关制品、炒货食品及坚果制品、方便食品等4大类食品12批次样品不合格。
据市场监督管理总局官网公布数据，2020年第三季度全国市场监管系统共完成食品安全监督抽检2234829批次，依据有关食品安全国家标准检验，检出不合格样品49534批次，总体不合格率为2.22%。
从食品抽样品种来看，消费量大的食用农产品，粮食加工品，食用油、油脂及其制品，肉制品，蛋制品，乳制品，抽检不合格率分别为1.81%、1.24%、2.03%、1.38%、0.31%、0.16%。与去年同期相比，方便食品、水果制品等21类食品不合格率有所降低，饮料、茶叶及相关制品等11类食品不合格率有所上升。
从检出的不合格项目类别看，农兽药残留超标、微生物污染、超范围超限量使用食品添加剂问题，分别占不合格样品总量的31.73%、26.19%、17.08%;质量指标不达标问题，占不合格样品总量的7.27%;有机物污染问题，占不合格样品总量的6.65%;重金属等元素污染问题，占不合格样品总量的5.97%。
浏览市场监督管理总局官网，在公示公告一栏中，公布的对食品抽查结果最多、抽查次数最频繁，而在抽查结果中，食品添加剂、微生物污染、农兽药残留超标和重金属污染、等问题屡查不绝，在食品不合格原因中出现频率最高。
在对食品安全“四个最严”监管的前提下，食品添加剂、微生物污染和农兽药残留超标等问题依然屡查不绝，严重威胁着人们食品安全。
“其实农兽药残留、非法添加、微生物等3类问题一直是食品安全的‘顽疾’，不仅是中国食品安全问题出现的主要‘原因’，全球来看同样如此”，中国农业大学食品科学与营养工程学院副教授朱毅曾指出。
施用农药化肥恶性循环导致源头污染
目前，我国化肥使用量虽然呈现负增长状态，但化肥消费量依然处于世界第一位。
农户为了提高产量大量使用化肥，导致土地碱花、板结，土壤变得越来越贫瘠，为了保住产量，不得不继续大量使用化肥。过度使用化肥等投入物,可能导致化肥、农药残留积累等,也造成初级农产品食品安全隐患。
专家认为，农民为了节约劳动成本，提高农产品的产量，过量使用农药和化肥，是导致农产品质量差的主要原因。
据统计，在近几年的农业发展过程中，农业中的化学物质用量越来越多，销售的农药平均每年170万吨，而且一些农药多数是国家禁止使用的。
由于化肥、农药的使用不合理、不规范,严重污染了土壤，初级农产品生产的土壤、场地、环境的变化,给农产品源头安全带来风险。养殖过程中乱用抗生素或其他药物，导致这些药物大量残留在动植物体内，造成食品安全问题。
容易在植物机体内残留的农药称为植物残留性农药，如六六六、异狄氏剂等;易于在土壤中残留的农药称为土壤残留性农药，如艾氏剂、狄氏剂等;易溶于水，而长期残留在水中的农药称为水体残留性农药，如异狄氏剂等杀虫效果好，见效快，被大多数农户大量施用，结果使病虫害产生了抗药性。当有了抗药性的病虫害又在危害田间的蔬菜时，就施用更大的药量来防治。如此恶性循环，蔬菜的农药残留就会大大增加。更严重的是有的农户还违章在蔬菜上使用禁、限农药，用药后，农药使用的安全间隔期还未到就忙于上市，造成严重的农药污染问题，成为对人体健康的严重威胁。
环境污染导致的食物源头污染
目前中国由于在重金属的开采、冶炼、加工过程中，造成不少重金属如铅、汞、镉、钴等进入大气、水、土壤引起严重的环境污染。
重金属在大气、水体、土壤、生物体中广泛分布，而底泥往往是重金属的储存库和最后的归宿。当环境变化时，底泥中的重金属形态将发生转化并释放造成污染。重金属不能被生物降解，但具有生物累积性，可以直接威胁高等生物包括人类。
由重金属或其化合物造成的环境污染，在藻类和底泥中积累，被鱼和贝类体表吸附，产生食物链浓缩，从而造成公害。
专家指出，农产品的质量与人体健康甚至人的生命息息相关。目前， 种植者、消费者的法律和责任意识仍然有待提高。
食品安全和环境污染以成为当前最重要的两大民生问题。解决食品安全的治理问题必须跳出食品安全问题本身。初级农产品的安全生产对环境污染问题的有效解决依赖性非常强。土壤、水、大气等环境要素的污染成为影响初级农产品食品安全生产的主要原因已获共识。
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